一般来说，肛裂手术麻醉失效后及首次排便时肛门会有疼痛，但这种疼痛一般比较轻微，多数不需要加用止痛药即可自行缓解。对于个别疼痛敏感的患者，亦可通过口服或肛门塞入镇痛药物或肛门皮下注射亚甲蓝等长效止痛剂或者肌肉注射镇痛药或镇痛泵等方法实现全程无痛。