通过用一些特殊材料填塞瘘管来治疗肛瘘，材料包括纤维蛋白胶、用冻干猪小肠黏膜下层脱细胞基质制作的生物修复栓等。瘘管填塞后，通过成纤维细胞的移动、激活及胶原蛋白网状结构的形成，促进瘘管的愈合。

利用生物修补片的特性，可以对抗肠内高压，防止细菌和感染物从内口进入瘘管的源头，还可以封闭加固薄弱、作为底物充填、当作支架引导等作用。

该法根据肛瘘形成的肛腺感染学说，从感染肛隐窝上方0.5cm到肛门上皮，对隐窝作一个卵圆形的切口，并且彻底清除内括约肌下的脓肿，从外口剜除瘘管，开放成口大底小的洞状创面，不切断肛门括约肌。

肛瘘之所以是国际医学难题，是因为手术损伤的问题一直没有解决，近年来临床出现保肛术式，但普遍的情况是疗效远达不到传统方法，这里介绍几个方法，我们况且称之为“肛瘘的微创术式”。

肛提肌参与肛管壁的组成，但肛提肌在这里叫联合纵肌。不要小看这个联合纵肌，它的作用一点不比括约肌差。它的主体肌纤维位于内外括约肌之间，但它的触觉很广，肌纤维到处延伸，广泛分布，不仅将内外括约肌捆绑在一起，还固定肛缘皮肤、肛管皮肤、直肠下端黏膜下血管。痔疮脱垂就是因为这个肌肉出了问题。

在腹腔的下面依次是腹膜、盆腔、盆底。盆底是由肌肉来封闭的，这些肌肉就是肛提肌，总共有三块，分别是耻骨直肠肌、耻骨尾骨肌和髂骨尾骨肌。

这种1934年英国S．mark医院的Milgan和Margan用齿线作为分界线。分法简单明了，实用性很强。齿线是肛门与直肠的分界线，可以在肛门镜下清晰可见。齿线处的肛窦是肛痿的感染内口，以此线为起点，向上就是高位肛瘘，向下就是低位肛瘘。