患者手术前需要做好术前检查、肠道准备（清洁灌肠）、术区备皮（剃去手术区域的毛发）、心理准备、饮食准备（忌食辛辣刺激物等），以及购置术后坐浴盆、护垫、一次性内裤以及其他日常洗漱用品。
肛窦炎手术风险主要有术中、术后大出血，以及术后伤口感染、术后伤口水肿、伤口愈合不良等。
肛窦炎如果不予治疗，炎症可能进一步扩大形成肛周脓肿；可能刺激肛乳头增生肥大形成肛乳头瘤；还可能因炎症持续刺激而致使分泌物增加，出现肛门潮湿、瘙痒。
肛窦炎手术创伤比较小，术后疼痛较轻，恢复时间相对较短。
肛窦炎手术几乎不损伤肛门括约肌，不会造成肛门失禁。
肛窦炎手术创伤较小，不会切除过多肛门皮肤组织，一般不会造成肛门狭窄。
因手术前会按常规做清洁灌肠，手术当天一般无大便，手术后第一天如有便意可以正常排便。
如不合并其他疾病，常规住院3天左右。
