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机械性损伤，如枪弹贯通伤、刀伤、骑跨伤、坠落贯通伤等；II.肠道异物损伤，如异物吞入嵌顿入肠壁及肛管所致的局部感染、肛门镜检查等；III.食物刺激，摄入大量刺激性食物而损伤肠壁等。
2022/09/07I.痔结扎术；II.肛裂切缝术；III.激光或冷冻术；IV.痔核冷冻术；V.各种吻合口炎症感染，如直肠癌、先天性巨结肠术后形成吻合口瘘；VI.会阴部的手术，例如内痔注射过深或手术后感染，产后会阴缝合后感染，前列腺、尿道手术后感染等，均可波及肛门直肠引起脓肿及瘘，肛管疾病手术后可能形成慢性感染灶，在内括约肌切断或闭合性痔手术后可能形成肛瘘。
2022/09/07肛裂是临床上的常见病，反复发生感染的肛裂可以合并皮下瘘，但是肛裂合并的肛瘘一般位于前后正中，不涉及肌肉，比较表浅，容易处理；II.痔一般不会继发肛瘘，但是血栓性痔溃烂感染后可形成皮下或黏膜下瘘管。
2022/09/07肛门周围皮肤的疾患，如化脓性汗腺炎、毛囊炎、皮脂腺囊肿合并感染等，均可引起肛瘘。
2022/09/07如骶骨结核、骨髓炎、骶前囊肿感染切开排脓或破溃后后形成肛瘘。
2022/09/07糖尿病、白血病、再生障碍性贫血等病，因机体抵抗能力降低，常由血行感染形成肛瘘。
2022/09/07典型的克罗恩病的肛周表现包括复发性肛周脓肿肛瘘、皮肤增生突起、肛管溃疡及狭窄。肛瘘常开口于肛周的皮肤，多有数个高位盲瘘和在肛管直肠环以上的瘘管。克罗恩病肛瘘在克罗恩病直肠侵犯中较为常见；溃疡性结肠炎的患者可以并发肛门周围疾病，如肛瘘、肛裂、肛周脓肿等。
2022/09/07如特殊感染（梅毒、艾滋病等）、结核杆菌感染、放射菌感染、直肠癌、多发性直肠息肉、淋巴肉芽肿等感染引起的肛瘘。
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